Новый подход к получению аналога КЭП-структуры с правильной ориентацией (Anti-Reverse Cap Analog, ARCA) 2mGpppG

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Предложен новый подход к синтезу ARCA (Anti-Reverse Cap Analog) классической структуры – диметилированного динуклеотида гуанозина 2mGpppG. Традиционный подход к его получению состоит в конденсации активированного 5′-дифосфата 7,3′-О-диметилгуанозина c 5′-монофосфатом гуанозина. Мы предлагаем использовать 3′-О-метилгуанозин только для синтеза 5′-монофосфата диметилированного гуанозина, а в конденсацию вводить активированный 5′-дифосфат гуанозина. Определены условия фосфорилирования 3′-O-метилгуанозина, позволяющие избежать образования побочного 3′-О-метил-5′- дезокси-5′-хлоргуанозин-2′-фосфата. ARCA синтезирован с высоким выходом (89% на стадии конденсации). Разработанный нами вариант синтеза легко масштабируется и удобен для получения граммовых количеств ARCA.

Ключевые слова

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. Л. Каюшин

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

К. В. Антонов

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Е. В. Дорофеева

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

М. Я. Берзина

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

А. О. Арнаутова

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

И. А. Прохоренко

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

А. И. Мирошников

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

И. Д. Константинова

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: kayushin.alexej@yandex.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Список литературы

  1. Peng Z.-H., Sharma V., Scott F. Singleton S.F., Paul D. Gershon P.D. // Org. Lett. 2002. V. 4. P. 161–164. https://doi.org/10.1021/ol0167715
  2. Rydzik A.M., Lukaszewicz M., Zuberek J., Kowalska J., Darzynkiewicz Z.M., Darzynkiewicz E., Jemielity J. // Org. Biomol. Chem. 2009. V. 7. P. 4763–4776. https://doi.org/10.1039/B911347A
  3. Grudzien-Nogalska E., Stepinski J., Jemielity J., Zuberek J., Stolarski R., Rhoads R.E, Darzynkiewicz E. // Methods Enzymol. 2007. V. 431. P. 203–227. https://doi.org/10.1016/S0076-6879(07)31011-2
  4. Stepinski J., Waddell C., Stolarski R., Darzynkiewicz E., Rhoads R.E. // RNA. 2001. V. 7. P. 1486–1495.
  5. Jemielity J., Fowler T., Zuberek J., Stepinski J., Lewdorowicz M., Niedzwiecka A., Stolarski R., Darzynkiewicz E., Rhoads R.E. // RNA. 2003. V. 9. P. 1108–1122. https://doi.org/10.1261/rna.5430403
  6. Yoshikawa М., Kato T., Takenishi T. // Bull. Chem. Soc. Jap. 1969. V. 42. P. 3505–3508.
  7. Kadokura M., Wada T., Urashima C., Sekine M. // Tetrahedron Lett. 1997. V. 38. P. 8359–8362. https://doi.org/10.1016/S0040-4039(97)10263-5

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Сайты конденсации при получении ARCA (I): (а) – классический вариант [5] (красная линия); (б) – предложенный нами (зеленая линия).

Скачать (176KB)
3. Рис. 2. Схема синтеза ARCA (I).

Скачать (442KB)
4. Рис. 3. Структура побочного продукта (VII) в синтезе 5′-монофосфата 7,3′-О-диметилгуанозина (V).

Скачать (39KB)

© Российская академия наук, 2024